京都市営地下鉄烏丸線・国際会館駅周辺には、駅北西の宝ヶ池通にＢＯＯＫＯＦＦ 京都宝ヶ池店があります。
コミックを中心に趣味、実用、文芸、文庫、一般書を扱っています。
無料駐車場があります。

叡山電鉄の一乗寺駅周辺の曼殊院通には古本を扱う店が４店あります。
店頭にトニー谷？の看板がある萩書房は映画、演劇、現代思想、サブカル系、趣味本、コミック、現代美術などを扱っています。
石川古本店は最近予約制にしたそうで、来店の際は事前連絡が必要だそうです。絶版漫画や趣味本などを扱っているようです。
恵文社は新刊書店ですが、古本も扱っていて、主にサブカル系や趣味本などを置いています。
2022年10月20日に「京都スターブックス」「小亀屋」「indigo book」「訪古堂」の合同店舗としてアリバイブックスがオープンしました。
４店がそれぞの本を販売しています。児童書、アート、サブカル、文学、文芸、文庫、その他を扱っています。

叡山電鉄・茶山(ちゃやま)駅周辺には、左京区の北大路通と東大路通の交差点に古本市場 高野店、駅の東に紫陽書院、東南の東鞍馬口通に欧文堂、北大路通りの北、線路近くにマヤルカ書店があります。
古本市場 高野店はホリデー・イン京都 ２Ｆから2013年1月に移転しました。
コミックを中心に、文庫、趣味、実用書、文芸を扱っています。
茶山駅東の紫陽書院は東洋史、中国文学、人文科学、唐本、一般書を扱っています。
欧文堂は探索当日には休みで詳細はわかりません。
マヤルカ書店は千本通から移転した店で、文学、絵本、婦人本、アート、文化、自然、民藝、児童書、雑貨を扱っています。

北大路通と東大路通の交差点ににあったコミックショック 高野店は2020年1月に閉店しました。

叡山電鉄・元田中(もとたなか)駅周辺には、福田屋書店があります。
東大路通と御蔭通の交差点から2012年始めに御蔭通から南に下がる路地の京都大学農学部向かいに移転しました。
歴史書哲学書を中心に文学、芸術、経済、法律、理工書などを扱っており、100円本も多数あります。